在做司法亲子鉴定的时候，主要采集的样本有以下几种：

1、血液样本。司法亲子鉴定一般都是采集指尖血，操作方便，提前DNA也不麻烦。

2、口腔黏膜样本。一般采用特定的口腔拭子取样。

3、指甲样本。一般取脚指甲作为样本。

4、头发样本。采集带有白色毛囊的头发作为样本。

5、牙齿样本。司法亲子鉴定还可采集牙齿作为样本。

用的最多的还是血液样本，无特殊情况，都要鉴定者本人到场，实名实人核验，现场取样，这样做出来的亲子鉴定结果才有法律效力